El Centro de Estudios Paisaje y Territorio (CEPT) se crea en 2005, mediante un convenio marco de colaboración suscrito entre la Consejería de Obras Públicas y Transportes de la Junta de Andalucía y las Universidades de Sevilla, Granada, Málaga, Córdoba, Cádiz, Almería, Huelva, Jaén, Internacional de Andalucía y Pablo de Olavide. La creación del Centro de Estudios Paisaje y Territorio responde al objetivo de ampliar la cooperación entre la Consejería de Obras Públicas y Transportes y las Universidades Públicas de Andalucía y fomentar con ello la interacción positiva entre las respectivas líneas de actividad, investigadores, científicos y docentes y del ejercicio de competencias en materia de paisaje y ordenación del territorio.
El Centro de Estudios Paisaje y Territorio es un ente adscrito al Plan Andaluz de Investigación, Desarrollo e Innovación pues procede –en su personal investigador y en las líneas de trabajo desarrolladas- del Grupo de Investigación Estructuras y Sistemas Territoriales (HUM-396) integrado por profesores de las Universidades de Sevilla, Pablo de Olavide y Huelva.
En marzo de 2006 se constituye el Consejo Rector del Centro, máximo órgano de decisión, que aprueba el primer programa de actividades de cuya ejecución se da cuenta en la presente memoria.